音乐学系目前设中国音乐史、中国传统音乐理论、西方音乐史、音乐美学、世界民族音乐理论、音乐艺术管理、音乐治疗7个专业方向，有民族音乐实验室、多媒体工作室、世界音乐演奏实习中心、欧洲早期音乐中心、音乐美学研究中心、音乐心理学研究室，另附设中央音乐学院远程教育学院认证课室。各专业所设课程总和已超过80余门。在这些理论课程中，有多门在国内属唯一开设。所有主干课程（含中国传统音乐、中国音乐史、西方音乐史、世界民族音乐、音乐美学）均具有我系教师自编教材和现代化教学能力。从建系至今，音乐学系教师已出版和发表专著、教材和论文万余部（篇），许多研究成果填补了国内外音乐学学科建设的空白，并被国内和海外多所院校采用。