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中国科学院
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  物理学院

  物理系

  近代物理系

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  工程与应用物理系

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  化学物理系

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  化学系

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  电子科学与技术系

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  生命科学学院

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  科技哲学教研部

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  大数据学院

  材料科学与工程学院(中国科学院金属研究所)

  天文与空间科学学院(紫金山天文台)

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  应用化学与工程学院(长春应化所)

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  环境科学与光电技术学院

  马克思主义学院(中共安徽省委党校共建)

  微电子学院(长春光学精密机械与物理研究所共建)

  软件学院

  苏州研究院

  上海研究院

  北京研究院

  先进技术研究院

  国家同步辐射实验室

  合肥微尺度物质科学国家研究中心

  火灾科学国家重点实验室

  量子信息与量子科技前沿协同创新中心

  核探测与核电子学国家重点实验室

  北京教学与管理部