我校生物医学工程专业建设始于1978年暨南大学复办时期,是国内最早从事生物医学材料及制品研究开发的单位；其倡导成立的中国生物医学工程学会生物材料分会是我国生物医学材料领域的权威学术交流平台，该专业拥有从本科生到博士后的完整培养体系。2000年开始正式招收本科生，2016年获批建设省级生物医学工程实验教学示范中心、省重点专业、省大学生校外实践基地；2017年获批省药物载体工程技术研究中心。

生物医学工程专业旨在培养德智体全面发展的生物医学工程专业应用型人才；培养其具有生命科学、生物材料学、医学电子学等相关的基础理论知识以及生物医学与工程技术相结合的科学研究能力；了解本专业的科学技术发展动态，能掌握运用所学知识从事生物医学工程相关领域的研究、生产、教学和管理；具有自主学习、终身学习、适应发展的能力。

专业主干课程包括：高等数学、普通物理学、计算机科学基础、医学生物学、生物化学、人体解剖生理学、有机化学、物理化学、高分子化学与物理、医学物理学、医学电子学、生物医学传感器、医疗器械与医学仪器、生物材料学、生物材料加工工艺学、生物材料测试方法、科技文献检索与应用。