学校共有三个校区和一个海外分校。分别是思明校区、翔安校区、漳州校区、马来西亚分校。厦门大学，由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，也是国家211工程和985工程重点建设的高水平大学。
思明校区：福建省厦门市思明区思明南路422号（361005）
翔安校区：福建省厦门市翔安区翔安南路（361102）
漳州校区：福建漳州招商局经济技术开发区南滨大道300号（363105）
马来西亚分校：马来西亚雪兰莪州雪邦沙叻丁宜（43900）
厦大本部包括：厦大老校地址，海韵教学区，厦大学生公寓，海滨教学区。
厦门大学漳州校区为厦门大学嘉庚学院所属。
厦门大学翔安校区位于厦门市翔安区新店镇，北依香山山脉、南临翔安南路，距思明校区34公里。总建筑面积115万平方米、总投资35亿元、占地总面积3645亩，比厦大校本部还要大。校区现已投入使用100多万平方米，预计到2021年，将有超过3万名的厦大本科生、硕士生、博士生在这里学习。
2014年10月17日，厦门大学马来西亚分校破土动工，标志着中国第一所海外大学正式诞生。厦大马来西亚分校位于首都吉隆坡西南45公里，在校生总规模1万人，包括本科生、硕士、博士三个教育层次，生源以马来西亚和东南亚国家为主，教师则采用全球招聘方式。