新疆综合类大学主要有新疆大学、塔里木大学、石河子大学、乌鲁木齐职业大学、阿克苏职业技术学院、巴音郭楞职业技术学院、新疆大学科学技术学院等。

| 本省排名 | 学校名称 | 全国排名 |
| 1 | 新疆大学 | 107 |
| 2 | 石河子大学 | 162 |
| 6 | 塔里木大学 | 375 |
| 8 | 昌吉学院 | 590 |
| 院校名称 | 学历层次 | 院校特性 |
| 新疆大学 | 本科/高职(专科) | 211 |
| 塔里木大学 | 本科/高职(专科) | |
| 石河子大学 | 本科/高职(专科) | 211 |
| 乌鲁木齐职业大学 | 高职(专科) | |
| 阿克苏职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 巴音郭楞职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 新疆大学科学技术学院 | 本科 | |
| 石河子大学科技学院 | 本科 | |
| 新疆石河子职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 新疆职业大学 | 高职(专科) | |
| 新疆生产建设兵团兴新职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 哈密职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 吐鲁番职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 博尔塔拉职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 和田职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 铁门关职业技术学院 | 高职(专科) | |
| 石河子工程职业技术学院 | 高职(专科) | |